大餐常吃也會膩啊翻譯后修飾,今天給大家推送一碟小菜
水蚤乙?;揎椀鞍妆磉_譜分析
Global proteomic analysis of protein acetylationaffecting metabolic regulation in Daphnia pulex
Biochimie IF=3.1
生物體中許多至關重要的生命進程不僅由蛋白質的相關豐度控制翻譯后修飾,還會被各種時空特意分布、可逆的翻譯后修飾調控,因此揭示翻譯后修飾的發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質復雜多樣的生物功能的一個重要前提?;谫|譜的修飾組學技術可以一次性的實現對復雜樣品中全部蛋白質進行大規(guī)模的修飾定性定量分析,成為蛋白功能研究領域新的熱點。
水蚤(Daphnia pulex)是一種微小的浮游動物,是生態(tài)毒理學研究的一個模式物種,用于環(huán)境毒性研究。水蚤基因組和蛋白組的測序完成為水蚤應對環(huán)境毒素的研究提供翻譯后修飾了堅實的基礎。環(huán)境毒素往往會引發(fā)水蚤代謝通路的變化,這些通路變化中涉及到賴氨酸乙?;揎棥1疚睦肔C-MS/MS對水蚤的乙?;揎椀鞍鬃V進行了全面定性分析。
圖:文章技術路線
本文作者最終檢測到65個蛋白上有98個乙?;揎椢稽c,通過生信分析(GO分析,KEGG分析)對檢測到的乙酰化修飾蛋白進行功能注釋與通路注釋,發(fā)現這些蛋白大多都與代謝過程有關。
圖:乙?;揎椀鞍坠δ芊治?/p>
翻譯后修飾(PTM)是蛋白功能調節(jié)中非常重要的一環(huán),很多蛋白的活性都會因為不同的修飾狀態(tài)而發(fā)生改變;近年來關于翻譯后修飾(PTM)的研究越來越熱。基于質譜技術的修飾蛋白質組學技術不僅可以對單個蛋白的修飾位點(準確定位發(fā)生修飾的氨基酸)進行定性分析,而且可以對修飾程度進行定量分析。目前來說,對于研究較少的物種材料,主要是非模式物種,某一特殊修飾表達譜分析就可以獲得非常不錯的研究成果。
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